Контроль соответствия требованиям ввоза в Европейский союз и вывоза из Европейского союза видов, занесённых в приложения A–D постановления Совета Европейского союза № 338/97/ЕС о защите природных видов животных и растений путём регулирования торговли ими (Официальный журнал ЕС L 061, 03.03.1997, стр. 1), происходит в определённых данным постановлением таможенных пунктах.
| Название и местонахождение таможенного пункта и таможенного учреждения | Живые животные | Части животного и его производные | Живые растения | Продукция растительного происхождения | ||
| Домашние животные | Подлежат ветеринарному контролю | Не подлежат ветеринарному контролю | ||||
| Пограничный пункт Лухамаа на шоссе Рига — Псков | U; E | + | HC, NHC | + | + | + |
| Пограничный пункт Мууга в порту Мууга | + (за искл. птиц) | HC, NHC-T(FR), NHC-NT | + | + | + | |
| Пограничный пункт Нарва-1 на шоссе Таллинн — Нарва | + | HC, NHC-NT | + | + | + | |
| Пограничный пункт Нарвская железная дорога на вокзале Нарвской железной дороги | + | + | Зерновые и древесина | |||
| Пограничный пункт Палдиски-2 в Южном порту Палдиски | + (за искл. птиц) | HC(2), NHC-NT(2) | + | + | + | |
| Пограничный пункт Таллинн-1 в Таллиннском Аэропорту | + | + | + | + | ||
| Пункт обслуживания (почта) Эндла и аэропорта | + | |||||
U — непарнокопытные и парнокопытные;
E — зарегистрированные представители семейства лошадиных;
HC — все виды продукции, потребляемой в качестве человеческой пищи;
NHC — другие виды продукции;
NT — без температурных требований;
T(FR) — замороженные изделия;
(2) — только упакованные изделия;
домашнее животное — собака, кошка, беспозвоночные (за искл. пчёл и раков), тропические декоративные рыбы, земноводные, рептилии, грызуны, все виды птиц (за искл. домашних птиц и инкубационных яйц).